Tru sở Đảng uỷ, HĐND, UBND xã Nguyễn Trãi, huyện Thường Tín nằm ngay sông Nhuệ, Khang trang.
UBND xã Nguyễn Trãi là cơ quan hành chính cấp xã hoạt động dưới sự giám sát của Hội đồng nhân dân và Ủy ban mặt trận Tổ quốc xã cùng cấp - Tuân thủ nguyên tắc lãnh đạo điều hành của Ban chấp hành đảng ủy xã Nguyễn Trãi và cơ quan hành chính cấp trên.